Szerző dc.contributor.author | Ács Éva | |
Szerző dc.contributor.author | Bíró Tibor | |
Szerző dc.contributor.author | Boros Emil | |
Szerző dc.contributor.author | Dobosy Péter | |
Szerző dc.contributor.author | Duleba Mónika | |
Szerző dc.contributor.author | Földi Angéla | |
Szerző dc.contributor.author | Kiss Keve T. | |
Szerző dc.contributor.author | Levkov Zlatko | |
Szerző dc.contributor.author | Orgoványi Péter | |
Szerző dc.contributor.author | Szén Orsolya Pálné | |
Szerző dc.contributor.author | Trábert Zsuzsa | |
Szerző dc.contributor.author | Vadkerti Edit | |
Szerző dc.contributor.author | Grigorszky István | |
Elérhetőség dátuma dc.date.accessioned | 2024-01-17T09:10:48Z | |
Rendelkezésre állás dátuma dc.date.available | 2024-01-17T09:10:48Z | |
Kiadás dc.date.issued | 2023 | |
Issn dc.identifier.issn | 2534-9708 | |
Uri dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.12944/21247 | |
Kivonat dc.description.abstract | The research presented investigates whether DNA-based metabarcoding can replace the morphology-based identification of diatom taxa in the ecological status assessments of aquatic habitats. When comparing data obtained with microscopy and metabarcoding, significant deviations have been noticed. One of the main reasons includes the incompleteness of the reference database used for taxonomic annotation of sequences. The database library should be complemented with species inhabiting unique habitats and having specific environmental requirements representing environmental endpoints for genetic diversification. Soda pans and soda lakes are examples of an extreme habitat with the loss of sodic character as the main threat , thus, accurate identification of species and exact information on their salinity tolerance is essential for adequate ecological status assessment. In the present study, by using microscopy and metabarcoding, we investigated taxa of the genus Halamphora that are common in soda pans and soda lakes. We detected six species of which Halamphora dominici and H. veneta occurred frequently and often in high abundance (it was often dominant having relative abundance higher than 5%). Analyses of DNA data confirmed the separation of the two species, as a result, the reference database library has been supplemented with sequences of H. dominici. Furthermore, we have confirmed that this species, which is a significant indicator of sodic character, shows a positive correlation with salinity. | |
Nyelv dc.language | en | |
Kulcsszó dc.subject | diatoms | |
Kulcsszó dc.subject | Halamphora | |
Kulcsszó dc.subject | halobity | |
Kulcsszó dc.subject | metabarcoding | |
Kulcsszó dc.subject | soda pans/lakes | |
Cím dc.title | Halamphora taxa in Hungarian soda pans and shallow soda lakes detected via metabarcoding and microscopic analyses | |
Típus dc.type | folyóiratcikk | |
Változtatás dátuma dc.date.updated | 2024-01-12T11:06:44Z | |
Változat dc.description.version | kiadói | |
Hozzáférés dc.rights.accessRights | nyílt | |
Doi azonosító dc.identifier.doi | 10.3897/mbmg.7.111679 | |
Tudományág dc.subject.discipline | Természettudományok | |
Tudományterület dc.subject.sciencebranch | Természettudományok/Biológiai tudományok | |
Mtmt azonosító dc.identifier.mtmt | 34449902 | |
Folyóirat dc.identifier.journalTitle | Metabarcoding and Metagenomics | |
Évfolyam dc.identifier.journalVolume | 7 | |
Terjedelem dc.format.page | 413-438 | |
Scopus azonosító dc.identifier.scopus | 85180964898 | |
Folyóiratcím rövidítve dc.identifier.journalAbbreviatedTitle | METABARCODING AND METAGENOMICS | |
Kiadás éve dc.description.issuedate | 2023 | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vízellátási és Csatornázási Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vízépítési Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Területi Vízgazdálkodási Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vizi Ökológiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Környezettudományi Doktori Iskola | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Hidrobiológiai Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | MTA ÖK BLI HBO Általános Limnológiai Kutatócsoport | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Ökológiai és Botanikai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vízellátási és Környezetmérnöki Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vízépítési és Vízgazdálkodási Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Hidrobotanikai Osztály | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vízépítési Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Területi Vízgazdálkodási Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Analitikai Kémiai Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Debreceni Egyetem | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | GINOP Fenntartható Ökoszisztémák Csoport | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Környezettudományi Doktori Iskola | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vizi Ökológiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Katonai Műszaki Doktori Iskola | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Biológiai és Ökológiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Környezetkémiai és Bioanalitikai Laboratórium (KBL) | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Restaurációs- és Állatökológiai Osztály |