Szerző dc.contributor.author | Bíró Tibor | |
Szerző dc.contributor.author | Duleba Mónika | |
Szerző dc.contributor.author | Földi Angéla | |
Szerző dc.contributor.author | Kiss Keve T. | |
Szerző dc.contributor.author | Orgoványi Péter | |
Szerző dc.contributor.author | Trábert Zsuzsa | |
Szerző dc.contributor.author | Vadkerti Edit | |
Szerző dc.contributor.author | Wetzel Carlos E. | |
Szerző dc.contributor.author | Ács Éva | |
Elérhetőség dátuma dc.date.accessioned | 2023-03-24T09:00:44Z | |
Rendelkezésre állás dátuma dc.date.available | 2023-03-24T09:00:44Z | |
Kiadás dc.date.issued | 2022 | |
Issn dc.identifier.issn | 2534-9708 | |
Uri dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.12944/20189 | |
Kivonat dc.description.abstract | Diatoms are valuable bioindicators and their traditional classification and identification are mainly based on the morphological characteristics of their frustules. However, in recent years, DNA-based methods have been proposed and are rapidly growing in the scientific literature as a complementary tool to assess the ecological status of freshwaters. Diatom-based ecological status assessment uses indices calculated from sensitivity and tolerance values as well as relative abundance of species. Correct assessment requires an accurate identification of species. In the present study, diatom assemblages of an oxbow lake were investigated using light and scanning electron microscopy as well as metabarcoding using rbc L marker, and the identification results were compared, intending to match barcode sequences of species that are currently missing in the diatom reference database. The investigated oxbow is an important wetland for bird conservation, although it is impacted by land use. Taxon lists based on morphology and metabarcoding considerably differed when bioinformatics analysis involved DADA2 pipeline with Diat.barcode database. Previously unknown sequence variants of four pennate species were found with additional BLAST search. Using phylogeny and p-distance calculations sequences could be matched to three small-celled naviculoid species that were found under a microscope. One of them was found to be a new species of the genus Mayamaea and was described as a new species, Mayamaea ectorii . Additionally, spatial distribution maps for several small-celled naviculoid species are provided for the Hungarian territory. | |
Nyelv dc.language | en | |
Kiadó dc.publisher | Pensoft | |
Kulcsszó dc.subject | Mayamaea | |
Kulcsszó dc.subject | metabarcoding | |
Kulcsszó dc.subject | new diatom species | |
Kulcsszó dc.subject | oxbow | |
Cím dc.title | Metabarcoding as an effective complement of microscopic studies in revealing the composition of the diatom community – a case study of an oxbow lake of Tisza River (Hungary) with the description of a new Mayamaea species | |
Típus dc.type | folyóiratcikk | |
Változtatás dátuma dc.date.updated | 2023-03-09T18:45:18Z | |
Változat dc.description.version | kiadói | |
Hozzáférés dc.rights.accessRights | nyílt hozzáférésű | |
Doi azonosító dc.identifier.doi | https://doi.org/10.3897/mbmg.6.87497 | |
Tudományág dc.subject.discipline | Természettudományok | |
Tudományterület dc.subject.sciencebranch | Természettudományok/Biológiai tudományok | |
Mtmt azonosító dc.identifier.mtmt | 33180178 | |
Folyóirat dc.identifier.journalTitle | Metabarcoding and Metagenomics | |
Évfolyam dc.identifier.journalVolume | 6 | |
Terjedelem dc.format.page | 319-336 | |
Folyóiratcím rövidítve dc.identifier.journalAbbreviatedTitle | METABARCODING AND METAGENOMICS | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Területi Vízgazdálkodási Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vízellátási és Csatornázási Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vizi Ökológiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Ökológiai és Botanikai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vízellátási és Környezetmérnöki Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Katonai Műszaki Doktori Iskola | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vízépítési és Vízgazdálkodási Intézet |