Szerző dc.contributor.author | Mónika Duleba | |
Szerző dc.contributor.author | Angéla Földi | |
Szerző dc.contributor.author | Adrienn Micsinai | |
Szerző dc.contributor.author | Gábor Várbíró | |
Szerző dc.contributor.author | Anita Mohr | |
Szerző dc.contributor.author | Rita Sipos | |
Szerző dc.contributor.author | Gyula Szabó | |
Szerző dc.contributor.author | Krisztina Buczkó | |
Szerző dc.contributor.author | Zsuzsa Trábert | |
Szerző dc.contributor.author | Keve T. Kiss | |
Szerző dc.contributor.author | Tibor Bíró | |
Szerző dc.contributor.author | Edit Vadkerti | |
Szerző dc.contributor.author | Éva Ács | |
Elérhetőség dátuma dc.date.accessioned | 2023-02-20T09:33:53Z | |
Rendelkezésre állás dátuma dc.date.available | 2023-02-20T09:33:53Z | |
Kiadás dc.date.issued | 2021 | |
Issn dc.identifier.issn | 1872-7034 | |
Issn dc.identifier.issn | 1470-160X | |
Uri dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.12944/19990 | |
Kivonat dc.description.abstract | Diatoms are widely applied in the ecological status assessment of aquatic ecosystems using indices calculated from pollution sensitivity and indicator values of species. Traditional, morphology-based identification of species requires in-depth taxonomic knowledge and expertise. Identifying taxa according to their barcode sequences obtained with high-throughput sequencing (metabarcoding) would be a promising alternative. In this pilot study, we tested the applicability of metabarcoding of benthic diatom assemblages for the ecological status assessment of Hungarian water bodies, comparing its performance to that of morphology-based identification of species. The barcode region of the rbcL gene was investigated in samples from running waters with various trophic states and unique lentic habitats, namely soda pans. For running waters, the Specific Pollution Sensitivity Index (IPS) and for soda pans the H index and the Indice Biologique Diatomées (IBD) were calculated from the morphology- and sequence-based abundances. The ecological quality ratio was determined for running waters. Overall, more infrageneric taxa were found with microscopy than with metabarcoding in the lotic and lentic samples. The correspondence between taxon lists detected by the two methods was relatively low but increased considerably in the case of morphologically dominant taxa. Community composition based on microscopy and DNA sequence analysis showed a significant correlation and was determined by the same main environmental drivers. Morphology-based indices strongly correlated with sequence-based indices. Both aspects indicated the same ecological status class for more than half of the lotic samples. In other cases, a status shift from good to moderate was frequent, a phenomenon that could prove problematic because the Water Framework Directive prescribes intervention for waters with a moderate or worse status. Considering discrepancies between the results obtained with microscopy and metabarcoding, using both methods in parallel could be proposed until the reference database has been suitably updated. | |
Nyelv dc.language | en | |
Kulcsszó dc.subject | Diatom | |
Kulcsszó dc.subject | Metabarcoding | |
Kulcsszó dc.subject | Morphology | |
Kulcsszó dc.subject | "Ecological status assessment" | |
Kulcsszó dc.subject | Running waters | |
Kulcsszó dc.subject | Soda pans | |
Cím dc.title | Applicability of Diatom Metabarcoding in the Ecological Status Assessment of Hungarian Lotic and Soda Pan Habitats | |
Típus dc.type | folyóiratcikk | |
Változtatás dátuma dc.date.updated | 2023-02-14T15:50:58Z | |
Változat dc.description.version | kiadói | |
Hozzáférés dc.rights.accessRights | nyílt hozzáférésű | |
dc.description.notes | A publikáció a Nemzeti Közszolgálati Egyetem 2020. évi Tématerületi Kiválóság Program keretében, a Fenntartható biztonság és társadalmi környezet elnevezésű projekt támogatásával valósult meg, az Innovációs és Technológiai Minisztérium Nemzeti Kutatási, Fejlesztési és Innovációs Alapból nyújtott támogatásával, a Nemzeti Kutatási, Fejlesztési és Innovációs Hivatal által kibocsátott támogatói okirat alapján. | |
Doi azonosító dc.identifier.doi | https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2021.108105 | |
Tudományág dc.subject.discipline | Természettudományok | |
Tudományterület dc.subject.sciencebranch | Természettudományok/Biológiai tudományok | |
Mtmt azonosító dc.identifier.mtmt | 32150341 | |
Folyóirat dc.identifier.journalTitle | Ecological Indicators | |
Évfolyam dc.identifier.journalVolume | 130 | |
Terjedelem dc.format.page | 1-14 | |
Wos azonosító dc.identifier.wos | 000693457200011 | |
Scopus azonosító dc.identifier.scopus | 85112760896 | |
Folyóiratcím rövidítve dc.identifier.journalAbbreviatedTitle | ECOL INDIC | |
Kiadás éve dc.description.issuedate | 2021 | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vizi Ökológiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vizi Ökológiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Tisza-kutató osztály | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vizi Ökológiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vizi Ökológiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vizi Ökológiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Területi Vízgazdálkodási Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vízellátási és Csatornázási Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Víz- és Környezetpolitikai Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vizi Ökológiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Ökológiai és Botanikai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Öntözési és Vízgazdálkodási Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vízellátási és Környezetmérnöki Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vízépítési és Vízgazdálkodási Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vízellátási és Csatornázási Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Mikrobiológiai Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Területi Vízgazdálkodási Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Víz- és Környezetpolitikai Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | GINOP Fenntartható Ökoszisztémák Csoport | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Duna-kutató Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Környezettudományi Doktori Iskola | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | MTMT Központi kezelésű szerzők | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Vizi Ökológiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Tisza-kutató osztály | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Ökológiai Kutatóközpont | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Magyar Természettudományi Múzeum | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Biológia Doktori Iskola |